＜ゲーム内容＞
同シリーズの第３弾。マップシステムやマップアイテム、新たなパワーアップなどにより、前作や前々作よりボリュームが大幅に増え、以降のスーマリ（シリーズ）にも大きな影響を与えた作品。各種タイムアタック、とりわけワープありのタイムアタックなど突き詰めたプレイが楽しめるのも魅力。ＳＦＣやＷｉｉの『スーパーマリオコレクション』、ＧＢＡ『スーパーマリオアドバンス４』などにも収録されている。
＜操作方法＞
十字ボタン上・・・扉に入ります。同時にＡボタンを押していれば場所により逆さ土管に入ることができます。同時にＡボタンを押せば水面からジャンプできます。
十字ボタン下・・・しゃがみます。（カエルマリオの時を除きます。）地形が坂になっている所では下の方へ滑り出します。（カエルマリオの時を除きます。）
十字ボタン左・右・・・左右へ歩きます。（同時にＢボタンを押すと走り、パワーメーターが上ります。）
セレクトボタン・・・ゲーム選択やコンティニュー等で使用。
スタートボタン・・・ゲームスタート。ゲーム中のポーズ機能。
Ａボタン・・・ジャンプ・・・長い間押すと、高くジャンプします。泳ぐ・・・水中では、押すごとに、どんどん浮き上がります。
Ｂボタン・・・走る（加速）、飛ぶ、持つ、蹴る、（しっぽマリオ、タヌキマリオの時）しっぽを振る、ファイアボール投げ。
＜ものがたり＞
マリオとルイージの活躍で平和になったキノコ王国ではありましたが、このキノコ王国はキノコワールドのほんの入口。その奥には多数の不思議な国がありました。さんざんこらしめたはずの大魔王クッパもマリオのいるキノコ王国からは手を引いたものの今度は自分の子供コクッパ７兄弟を仲間に入れ、ワールドのあちこちでイタズラのやり放題。遂には各国に古くから伝わる魔法の杖を盗み出し王様達を動物の姿に変えてしまいました。マリオとルイージはコクッパから杖を奪い返し、王様を元の姿に戻してあげなくてはなりません。｢行ってらっしゃい。気をつけてネｩ｣ピーチ姫とキノピオに見送られて２人は不思議いっぱいのキノコワールドの奥へ奥へと進んでゆくのでした。
